Sans industrie, ruiné par le sanglant régime dictatorial de Macias Nguema, cause d'une émigration très importante, le pays, qui a subi une crise économique profonde à la suite de l'effondrement des cours du café et du cacao, tire la moitié de son PNB de l'aide internationale. La dévaluation du franc CFA (1994) a été compensée par une remise de 50 % de sa dette extérieure, qui était très lourde.
L'agriculture est centrée sur les produits d'exportation, surtout le bois (okoumé, ébène) qui constitue la première richesse du pays. Le cacao de l'île de Bioco fait de la Guinée-Équatoriale le 4e producteur mondial. Les autres produits d'exportation sont le café et les arachides. Le climat permet des cultures vivrières (manioc, bananes), complétées par l'élevage, et la balance agricole est excédentaire (1 % du PNB).
Les autorités ont conclu, en avril 1990, un accord avec une société américaine pour l'exploitation du gisement de pétrole off shore d'Alba dont la production a débuté en 1992.