Le Burundi bénéficie d'un climat tropical tempéré par l'altitude. Les rythmes pluviométriques sont subéquatoriaux: une saison sèche, en juin-septembre, puis la petite saison de pluies (octobre–janvier), séparée de la grande par une courte rémission des précipitations, en février. Les pluies, plus fortes au nord, varient selon l'altitude et l'exposition: les rives du Tanganyika ne reçoivent que 650 mm, tandis que la pluviométrie moyenne est de 1.500 mm dans les régions les plus élevées, de 1.200 mm à l'est. Les températures varient de même: les moyennes, fortes dans l'Imbo (20 à 23 °C), ne dépassent pas 15 °C sur la crête, 17 à 20 °C sur les plateaux centraux.